随着深圳湾口岸推出网上预约系统方便过境人士预约接受病毒检测后，口岸人流挤塞情况已有改善，但过境人士目前仍要在两地重复接受核酸检测。香港特区政府医务衞生局局长卢宠茂透露，正研究拉近内地与香港的病毒检测标准，至于如何合并至“两地一检”（即过关全程只检测一次），则需更多时间考虑。有防疫专家指出，两地口岸的距离接近，“两地一检”在技术层面上可行，但先决条件是两地必须有统一的检测标准，及交由同一个团队进行採样和化验，以确保检测品质一致，而检测亦必须在离境前进行，以杜绝输出病毒。

目前，市民欲经深圳湾口岸前往内地，必须持24小时内有效的核酸检测纸本报告。在抵达深圳湾港方口岸后，要即场进行核酸检测，呈阴性结果才可前往深方口岸。当到达深方口岸后，须再做一次核酸检测，即过关旅客需在24小时内共接受3次检测，每次要花时间等候检测结果。早前就有建议在深圳湾口岸採取“两地一检”方式，让旅客在过关时只需接受一次核酸检测。

但要落实该做法，需要先解决内地与香港的检测标准不同的问题，而两地对确诊的标准亦有不同定义。在内地，核酸检测CT值低于40被视为阳性，但在香港，CT值在30以上却是阴性。正因彼此对CT值有不同理解，故出现在香港过关时检测呈阴性，几分钟后到达内地关口检测却呈阳性。